A determinação exata da concentração de micotoxinas dentro de um lote é bastante difícil de ser feita, dependendo da distribuição heterogênea destas na massa de grãos. A amostragem é uma etapa muito importante, porque é necessária uma amostra representativa que ofereça um resultado de análise confiável. Infelizmente, não é possível coletar uma amostra com 100% de confiabilidade.